Rozstrzyganie wątpliwości na korzyść podatnika i inne zmiany w Ordynacji podatkowej

W Dzienniku Ustaw opublikowano dwie ustawy nowelizujące Ordynację podatkową. Chodzi o:

• ustawę z 12 września 2025 r. o zmianie ustawy – Ordynacja podatkowa (Dz.U. z 2025 r. poz. 1417)
• ustawę z 12 września 2025 r. o zmianie ustawy – Ordynacja podatkowa (Dz.U. z 2025 r. poz. 1414).

Wprowadzane zmiany stanowią realizację filaru VI: Wsparcie dla biznesu i deregulacja planu gospodarczego na 2025 r. Polska. Rok przełomu, który zakłada eliminację zbędnych procedur administracyjnych, redukcję kosztów prowadzenia działalności oraz zwiększenie przejrzystości systemu podatkowego.

Jeżeli w postępowaniu podatkowym wszczętym z urzędu nie da się jednoznacznie ustalić stanu faktycznego, to wątpliwości te będą rozstrzygane na korzyść podatnika.

Zasada rozstrzygania wątpliwości na korzyść podatnika nie będzie stosowana w trzech sytuacjach:

1. Gdy w postępowaniu biorą udział strony o sprzecznych interesach lub decyzja może mieć wpływ na inne osoby.
2. Gdy przepisy wymagają, aby to podatnik udowodnił określone fakty.
3. Gdy rozstrzygnięcie na korzyść podatnika byłoby sprzeczne z ważnym interesem publicznym lub państwa.

Dodany przepis znajdzie zastosowanie we wszystkich innych niż postępowanie podatkowe, procedurach, jeżeli przepisy normujące te procedury zawierają stosowne odesłania.

Nowe przepisy będą miały zastosowanie także do postępowań wszczętych i niezakończonych przed dniem wejścia w życie tej ustawy.

Druga z podpisanych nowelizacji Ordynacji podatkowej zakłada, że odsetki za zwłokę od zaległości podatkowych nie będą naliczane, jeśli kontrola podatkowa lub celno-skarbowa nie zakończy się w ciągu 6 miesięcy od jej rozpoczęcia.

Odsetki nie będą naliczane za okres od dnia następnego po upływie tego terminu do zakończenia kontroli.

Do tego 6-miesięcznego terminu i okresu bez naliczania odsetek nie wlicza się:

1) terminów przewidzianych w przepisach prawa podatkowego dla dokonania określonych czynności;

2) okresów zawieszenia kontroli podatkowej i kontroli celno-skarbowej, z wyjątkiem:

a) zawieszenia kontroli przejętej przez Szefa KAS, jeśli sprawa dotyczy unikania opodatkowania i kontrola została przekazana do organu podatkowego po umorzeniu postępowania,

b) zawieszenia kontroli podatkowej z powodu braku danych identyfikujących kontrolowanego;

3) opóźnień spowodowanych z winy strony lub jej przedstawiciela albo z przyczyn niezależnych od organu.

Nowe zasady będą dotyczyć także kontroli podatkowych i celno-skarbowych, które rozpoczęły się w ciągu 6 miesięcy przed wejściem w życie ustawy i nie zostały jeszcze zakończone w tym dniu.

Obie ustawy zostały ogłoszone w Dzienniku Ustaw 20 października br. i wchodzą w życie 4 listopada 2025 r.

Wprowadzone rozwiązania mają ułatwić prowadzenie działalności i poprawić pozycję podatników w sporze z organem. Nowe przepisy ograniczają ryzyko i koszty związanych z przedłużającymi się kontrolami.

Polecamy też:

Zmiany podatkowe 2025 – co nowego w CIT, VAT, Ordynacji i akcyzie?

Klauzula przeciwko unikaniu opodatkowania – zmiany w Ordynacji podatkowej

Interpretacje indywidualne 2025 – zmiany w Ordynacji podatkowej i publikacja w systemie EUREKA

Odsetki za czas kontroli podatkowej – korzystne zmiany w Ordynacji podatkowej 2025