Częściowa korekta deklaracji po kontroli celno-skarbowej 2026 – co się zmienia dla podatników

Na stronie Rządowego Centrum Legislacji (RCL) 29 kwietnia 2025 r. został opublikowany projekt ustawy o zmianie ustawy o Krajowej Administracji Skarbowej oraz ustawy o podatku od towarów i usług. Jest on elementem realizacji filaru VI: „Wsparcie dla biznesu i deregulacja” planu gospodarczego na 2025 rok „Polska. Rok przełomu”. Plan ten zakłada m.in. eliminację zbędnych procedur administracyjnych, redukcję kosztów prowadzenia działalności oraz zwiększenie przejrzystości systemu podatkowego. Zawarte w projekcie rozwiązania mają usprawnić kontrole i zmotywować podatników do dobrowolnego wykonywania swoich obowiązków.

Praktyka pokazuje – na co zwrócili uwagę autorzy nowelizacji – że na gruncie obowiązujących przepisów ustawy z 16 listopada 2016 r. o Krajowej Administracji Skarbowej (ustawy o KAS) powstają wątpliwości interpretacyjne, czy możliwe jest dobrowolne wykonywanie przez podatnika (kontrolowanego) obowiązku podatkowego w postaci złożenia korekty deklaracji, w której zgadza się on ze stwierdzonymi w wyniku kontroli celno-skarbowej nieprawidłowościami jedynie w części. Wątpliwości dotyczą także uprawnienia do złożenia tzw. deklaracji „pierwotnej” po wszczęciu i zakończeniu kontroli celno-skarbowej, jeżeli nie została wcześniej złożona. Nowelizacja ma je wyeliminować.

Na podstawie art. 82 ust. 3 ustawy o KAS w jej obecnym brzmieniu, podatnik ma możliwość złożenia korekty deklaracji uwzględniającej całość nieprawidłowości stwierdzonych w wyniku kontroli, jeżeli przedmiotem jest konkretne zobowiązanie podatkowe.

Jeżeli jednak kontrolowany zgadza się ze stwierdzonymi nieprawidłowościami wyłącznie w części tych nieprawidłowości, to – jak wskazali projektodawcy – złożona przez niego korekta deklaracji w tym zakresie nie zostanie uwzględniona przez naczelnika urzędu celno-skarbowego. W konsekwencji kontrola celno-skarbowa przekształci się w postępowanie podatkowe, którego przedmiotem jest całość zobowiązania podatkowego będącego przedmiotem tej kontroli.

Na czym polegają zmiany w korekcie deklaracji po kontroli celno-skarbowej 2026

Nowelizacja ma to zmienić, umożliwiając podatnikom składanie korekty deklaracji po zakończeniu kontroli celno-skarbowej (doręczeniu kontrolowanemu wyniku kontroli celno-skarbowej), gdy kontrolowany zgadza się ze stwierdzonymi w wyniku kontroli celno-skarbowej nieprawidłowościami jedynie w części.

Projekt ustawy nowelizującej zakłada również inne istotne dla  kontrolowanych zmiany, odpowiednio w art. 62, art. 82 i art. 83 ustawy o Krajowej Administracji Skarbowej.

Po wejściu nowych regulacji w życie, możliwe będzie składanie „pierwotnych” deklaracji podatkowych:

• w terminie 14 dni od dnia wszczęcia kontroli celno-skarbowej (doręczenia kontrolowanemu upoważnienia do kontroli celno-skarbowej) – jeżeli nie została złożona przed wszczęciem tej kontroli,
• po zakończeniu kontroli celno-skarbowe (w terminie 14 dni od dnia doręczenia kontrolowanemu wyniku kontroli) – jeżeli nie została złożona przed wszczęciem i po wszczęciu tej kontroli.

W ocenie projektodawców, zaproponowane rozwiązania umożliwią szybsze zakończenie kontroli celno-skarbowej i nieprowadzenie postępowania podatkowego względem kontrolowanego, jeżeli kontrolowany złoży deklarację lub korektę deklaracji zgodnie z projektowanymi przepisami.  Umożliwią również nienaliczanie dalszych odsetek za zwłokę w wyniku zapłaty zaległości podatkowej wynikającej ze złożonej deklaracji lub korekty deklaracji.

Zmiany będą dotyczyć także przepisów o VAT. Mają one charakter techniczny i dostosowujący, będąc konsekwencją rozszerzenia uprawnień podatników zawartych w ustawie o KAS. Mianowicie zostanie zmodyfikowana treść art. 112b ust. 2a ustawy o VAT. Zmiana ta umożliwi ustalenie stawki dodatkowego zobowiązania podatkowego na obniżonym poziomie do 15%, również w przypadku złożenia przez kontrolowanego „pierwotnej” deklaracji, po wszczęciu kontroli celno-skarbowej.

Nowe przepisy wejdą w życie 1 stycznia 2026 r., co wynika z art. 4 projektu nowelizacji. Termin wejścia w życie jej przepisów uzasadniono m.in. ich wpływem na obowiązki i uprawnienia podatników, co wymaga zapewnienia stosownego „vacatio legis”, aby umożliwić im dostosowanie się do nowych regulacji.

Ponadto pozwala on naskorelowanie zmian ustawy o KAS ze zmianami przepisów wykonawczych w zakresie podatków dochodowych (m.in. rozporządzenia MF w sprawie  prowadzenia podatkowej księgi przychodów i rozchodów).

Źródło:

• projekt (z 24 kwietnia 2025 r.) ustawy o zmianie ustawy o Krajowej Administracji Skarbowej oraz ustawy o podatku od towarów i usług.